Kannabium · agente de IASec

SEC · CURADORIA CIENTÍFICA · GESTÃO DE EVIDÊNCIAS

Sec · Agente de IA para curadoria científica e gestão de evidências.

Sec reúne fontes científicas, normaliza metadados, classifica evidências e coordena análises antes da revisão humana e da publicação.

Sec diante de painéis holográficos que conectam plantas, animais e dados científicos
Ilustração editorial sobre plantas, animais e dados científicos

01 · CAPACIDADES

Etapas de curadoria, validação e publicação

Sec separa aquisição, normalização, validação, interpretação e publicação. Essa sequência mantém fatos, inferências, hipóteses e recomendações em camadas distintas.

CAPACIDADE 01

Curadoria científica

Recebe fontes primárias e secundárias, identifica sua função e prepara registros atentos à proveniência.

  • DOI, PMID, taxonomia e identificadores persistentes
  • escopo, método, data e versão da fonte
  • grau da evidência e limites interpretativos
CAPACIDADE 02

Integração de dados para identificar relações

Integra dados fragmentados para revelar relações úteis sem transformar associação em causalidade.

  • aquisição e limpeza orientadas pela pergunta
  • construção de atributos e matrizes analíticas
  • hipóteses separadas dos resultados observados
CAPACIDADE 03

Bioinformática evolutiva

Conecta sistemática, filogenia, homologia, ortologia, genômica comparativa e diversificação de metabólitos.

  • relações entre táxons e caracteres
  • incerteza, suporte e escolha do método
  • tradução da análise em interfaces científicas
CAPACIDADE 04

Governança do conhecimento

Preserva a linhagem dos dados e torna auditável o percurso entre a fonte e a publicação.

  • entidade, evidência, relação e versão
  • vocabulário controlado e nomes canônicos
  • registro explícito do que não pode ser concluído
CAPACIDADE 05

Preparação de páginas, painéis e pacotes de dados

Transforma conhecimento curado em observatórios, páginas editoriais, painéis, gráficos e pacotes preparados para SGBD ou API.

  • hierarquia editorial e acessibilidade
  • dados que permanecem legíveis sem JavaScript
  • separação entre conteúdo, visualização e interação
CAPACIDADE 06

Revisão crítica

Questiona extrapolações, confronta fontes e explicita quando uma conclusão depende de inferência.

  • comparação entre fontes e métodos
  • detecção de lacunas e conflitos
  • recomendações proporcionais à evidência
CAPACIDADE 07

Seleção e registro de fontes

Seleciona fontes de referência e registra por que cada uma é relevante para a pergunta.

  • prioridade da fonte e rota de acesso
  • escopo, direitos e estado de atualização
  • decisões de recuperação com proveniência
CAPACIDADE 08

Normalização semântica

Concilia nomes, identificadores, unidades e vocabulários controlados em registros heterogêneos.

  • nomes canônicos e sinônimos
  • mapeamento de identificadores
  • consistência de unidades e campos
CAPACIDADE 09

Classificação da evidência

Distingue evidência experimental, revisão, inferência, hipótese e recomendação.

  • vínculo entre afirmação e fonte
  • robustez metodológica
  • rótulos de confiança e limitação
CAPACIDADE 10

Resolução taxonômica

Resolve nomes aceitos, sinônimos, escopo do táxon e classificação antes da comparação biológica.

  • identidade e autoridade taxonômica
  • comparações atentas à linhagem
  • versionamento da classificação
CAPACIDADE 11

Análise filogenética

Estrutura alinhamentos, inferência de árvores, valores de suporte e incerteza para questões evolutivas.

  • evidências de caracteres e sequências
  • seleção de métodos
  • interpretação dentro do escopo
CAPACIDADE 12

Genômica comparativa

Compara genes, proteínas, ortólogos e regiões genômicas preservando o contexto de versão.

  • homologia e ortologia
  • relações entre genomas e sequências
  • entradas reprodutíveis para comparação
CAPACIDADE 13

Síntese da literatura

Constrói sínteses rastreáveis entre artigos sem apagar diferenças de métodos ou populações.

  • comparação do desenho dos estudos
  • agrupamento de afirmações
  • síntese vinculada às citações
CAPACIDADE 14

Gestão de hipóteses

Registra hipóteses, pressupostos, previsões e testes como objetos científicos distintos.

  • registro de pressupostos
  • previsão e contraexemplo
  • estado da hipótese
CAPACIDADE 15

Modelagem de dados

Traduz entidades e relações curadas em esquemas, matrizes, grafos de conhecimento e registros preparados para APIs.

  • projeto de entidades e relações
  • proveniência no nível do campo
  • pacotes estruturados para publicação
CAPACIDADE 16

Avaliação de agentes

Testa a fundamentação, a completude, a consistência, a reprodutibilidade e a conformidade dos resultados.

  • casos de teste da pergunta à resposta
  • detecção de falhas e desvios
  • pontos de revisão humana
CAPACIDADE 17

Segurança e privacidade

Impede, por padrão, que segredos e contextos privados sejam incorporados a produtos públicos.

  • credenciais apenas no back-end
  • limites explícitos de contexto
  • distribuição com privilégio mínimo
CAPACIDADE 18

Observabilidade e auditoria

Registra execuções, entradas, versões, decisões e estado de publicação para uma operação responsável.

  • linhagem da execução
  • verificação de contratos e políticas
  • trilha de auditoria revisável
CAPACIDADE 19

Comunicação científica

Transforma evidências governadas em comunicação científica clara para pesquisadores, instituições e tomadores de decisão.

  • linguagem adequada ao público
  • hierarquia visual e semântica
  • sínteses que preservam as afirmações
CAPACIDADE 20

Desenho de fluxos de trabalho

Mapeia sequências repetíveis da pergunta à fonte, análise, revisão e entrega.

  • decomposição de tarefas
  • contratos de transferência
  • padrões operacionais reutilizáveis

02 · ORQUESTRAÇÃO

Como o Sec coordena agentes especializados

Sec atua como coordenador: distribui tarefas, preserva contratos de saída, reúne resultados e encaminha a resposta para revisão humana ou publicação governada.

Delimitar a pergunta

Define a pergunta, o organismo, o domínio, a escala temporal e a decisão que o resultado deve apoiar.

Selecionar agentes

Ativa agentes de curadoria, evolução, dados, segurança, produto ou controle de qualidade conforme a tarefa.

Comparar resultados

Compara resultados, verifica conflitos, avalia evidências e mantém a incerteza visível.

Preparar a entrega

Produz uma resposta, registro governado, interface ou pacote estruturado com rastreabilidade.

REGRA FUNDAMENTAL

Toda resposta deve permanecer vinculada às fontes.

Sec registra a origem da informação e distingue resultados observados de interpretações, hipóteses e recomendações.

03 · CONECTORES

Fontes e conectores utilizados pelo Sec

Os conectores localizam, normalizam e referenciam fontes. Cada integração deve respeitar permissões de acesso, direitos de uso, limites de requisição, versões e regras de atribuição.

Literatura

PubMed · DOI · OpenAlex

Localiza artigos, revisões, metadados, autores, identificadores e relações bibliográficas.

  • source_id
  • publication_date
  • method_scope
Taxonomia

NCBI · IPNI · Kew

Confronta nomes aceitos, sinônimos, autorias, linhagens e identificadores taxonômicos.

  • taxon_id
  • accepted_name
  • classification
Genômica

NCBI · GenBank · RefSeq

Encaminha sequências, montagens, genes, regiões e registros comparativos com contexto de versão.

  • accession
  • sequence_scope
  • version
Proteínas

UniProt · Ensembl · OrthoDB

Conecta proteínas, ortologia, função anotada, evidência experimental e comparação evolutiva.

  • protein_id
  • evidence_code
  • orthology_relation
Estruturas

PDB · AlphaFold DB

Relaciona estruturas, ligantes, resíduos, estados conformacionais e modelos preditos com suas limitações.

  • structure_id
  • experimental_method
  • model_status
Química e saúde

PubChem · ChEMBL · instituições

Organiza compostos, bioatividade e indicadores de saúde sem confundir molécula, produto, mercado e população.

  • compound_id
  • assay_context
  • population_scope
Metadados bibliográficos

Crossref · Europe PMC

Resolve metadados de DOI, resumos, links para texto completo, estado da publicação e contexto de citação.

  • doi
  • abstract_status
  • full_text_route
Arquivos de sequências

ENA · SRA

Conecta leituras brutas, projetos, amostras e contexto do estudo respeitando limites de acesso controlado.

  • run_accession
  • sample_id
  • access_policy
Anotação funcional

InterPro · Pfam

Relaciona domínios proteicos, famílias, regiões conservadas e interpretação funcional.

  • domain_id
  • family_id
  • annotation_evidence
Vias biológicas

KEGG · Reactome

Mapeia vias, reações, contexto do organismo e processos moleculares para entidades biológicas.

  • pathway_id
  • reaction_id
  • organism_scope
Redes de interação

STRING

Conecta associações entre proteínas mantendo distintos os canais experimentais, curados, preditos e de coexpressão.

  • protein_pair
  • evidence_channel
  • confidence_score
Expressão gênica

GEO

Encaminha conjuntos de expressão, amostras, plataformas, desenhos de estudo e contexto de processamento.

  • series_id
  • sample_id
  • platform
Biodiversidade

GBIF · iNaturalist

Organiza registros de ocorrência, coordenadas, incerteza da observação e contexto taxonômico.

  • occurrence_id
  • geospatial_scope
  • observation_quality
Saúde pública

EUDA · OMS · FDA

Separa indicadores institucionais, registros regulatórios, escopo populacional e interpretação de políticas.

  • indicator_id
  • jurisdiction
  • interpretive_boundary
Germoplasma

GRIN · Genesys

Conecta acessos, registros de germoplasma, contexto do material e metadados de coleta.

  • accession_id
  • material_type
  • collection_context

04 · ARQUITETURA FUTURA

Arquitetura modular do Sec

A arquitetura separa o núcleo científico, o pacote instalável, os adaptadores de fontes e os projetos que utilizam o agente. Essa divisão permite controlar versões, acessos e os contextos distribuídos a cada projeto.

CAMADA 01 · NÚCLEO CANÔNICO

Núcleo do Sec

A camada científica durável: capacidades, contratos, políticas e registro. Nela, o modelo de conhecimento e os limites da evidência permanecem canônicos.

{ skills, contracts, policies, registry }
CAMADA 02 · DISTRIBUIÇÃO

Plugin do agente

Uma distribuição instalável com metadados do produto, interface, capacidades declaradas, versionamento e modelo de ativação controlado.

plugin.manifest(capabilities, interface, version)
CAMADA 03 · ADAPTADORES

Adaptadores de domínio

Os adaptadores conectam o Kannabium, o plant_connectors_core, a recuperação bibliográfica e domínios futuros sem alterar o núcleo canônico.

adapter.connect(source, contract, policy)
CAMADA 04 · PROJETOS

Projetos que utilizam o Sec

Os projetos recebem somente a distribuição necessária. Contextos privados não são incluídos por padrão; o acesso deve ser explícito, delimitado e governado.

project.consume(plugin, approved_context)

APLICAÇÃO ACADÊMICA E COMERCIAL

O modelo preserva a rastreabilidade das evidências e controla o acesso aos resultados.

Em pesquisas, Sec registra proveniência, incerteza, método e identidade taxonômica. Em implantações institucionais ou comerciais, as quatro camadas permitem definir licenciamento, integrações, acessos e expansão de domínios sem distribuir contextos privados por padrão.